Virus- och bakteriesjukdomar är mycket ovanligare än övriga typer av växtsjukdomar. De är också i princip omöjliga att behandla – i alla fall i en hemträdgård. Det enda man kan göra är att så fort som möjligt avlägsna den angripna växten innan den hinner föra smittan vidare till andra växter i trädgården.

Många virussjukdomar överförs av bladlöss. De överförs även till växternas avkomma, även genom frön. Till skillnad från djur kan växter inte bilda antikroppar som bekämpar viruset. Välj resistenta sorter och virusfritt utsäde när det är möjligt.